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腫瘤生態(tài)圈 | DNBSEQ在實體腫瘤MRD檢測中的應(yīng)用

時間:2022-05-26作者:華大智造閱讀數(shù):8084分享

過去的5月,如果用一個詞來總結(jié)腫瘤精準診療的熱點,那一定非“MRD”莫屬了。


MRD(Minimal Residual Disease),即微小殘留病灶,是腫瘤患者治療后體內(nèi)持續(xù)存在的低于常規(guī)檢測(如顯微鏡觀察或血液異常蛋白等)限的殘留腫瘤細胞或相關(guān)生物標志物,這也被認為是導(dǎo)致腫瘤復(fù)發(fā)的根源。實體腫瘤中ctDNA是最為常用檢測標志物,ctDNA-MRD也被視為繼伴隨診斷、早篩之后推動腫瘤診療革新的新興賽道,市場前景廣闊,腫瘤企業(yè)紛紛開始布局。


實體瘤ctDNA-MRD的臨床應(yīng)用從中晚期用藥的療效評估、復(fù)發(fā)監(jiān)測,向早中期的術(shù)后(新)輔助治療指導(dǎo)和預(yù)后評估發(fā)展,以NSCLC為代表的多中心前瞻性研究已發(fā)布階段性結(jié)果。


2021年11月,四川大學華西醫(yī)院劉倫旭教授團隊聯(lián)合多家醫(yī)院及臻和生物發(fā)布了LUNGCA-1(330例I-III期NSCLC患者)的研究成果1,揭示了術(shù)后一月內(nèi)ctDNA可作為預(yù)測復(fù)發(fā)和MRD檢測的標志物,圍術(shù)期術(shù)后ctDNA-MRD陽性是患者RFS縮短的獨立危險因素,并且ctDNA-MRD狀態(tài)與輔助治療結(jié)果相關(guān),MRD陽性患者,輔助治療可提高患者RFS。

5月14日,廣東省人民醫(yī)院吳一龍教授團隊和吉因加合作開展的大型肺癌MRD前瞻性研究成果發(fā)布在國際頂級期刊Cancer Discovery雜志上2,該研究首次通過動態(tài)監(jiān)測中MRD的超高陰性預(yù)測值定義了潛在治愈人群,發(fā)現(xiàn)術(shù)后MRD陰性人群無法從輔助治療中獲益,闡明術(shù)前Nonshedding腫瘤的存在不影響術(shù)后MRD監(jiān)測,同時探索了II/III期肺癌術(shù)后MRD轉(zhuǎn)陽的高風險期(術(shù)后12-18個月)。


5月初FDA更是發(fā)布了《ctDNA用于早期實體瘤藥物開發(fā)指南草案》,旨在幫助計劃使用ctDNA作為生物標志物進行研究性新藥申請(IND)和/或支持用于治療早期實體腫瘤藥物和生物制品的上市批準3,在檢測分析進一步標準化的前提下,ctDNA作為臨床試驗中患者的分層因素甚至早期終點也即將成為可能。


目前,ctDNA-MRD主要分為“tumor-informed assays (通過對腫瘤組織進行WES測序,然后選擇一組變異進行追蹤,設(shè)計定制化的ctDNA panel) 和“ tumor-na?ve/ agnostic assays (通常采用固定panel,以驅(qū)動基因和靶向藥物基因為設(shè)計思路,常結(jié)合如甲基化等的多組學方法進行檢測) ” 兩種截然不同的技術(shù)路線,兩種方案各自有自身的獨特優(yōu)勢,商品化的產(chǎn)品也已推出。此外,隨著檢測企業(yè)對中國人群的腫瘤(如肺癌、結(jié)直腸癌、肝癌等)分子特征的研究深入,基于人群特征設(shè)計的固定panel(Population based Panel),用于臨床腫瘤組織伴隨診斷和ctDNA-MRD監(jiān)測的方案也有成為主流之勢,上述提到的臻和生物、吉因加發(fā)起的臨床研究均采用了類似的技術(shù)方案,并且可在MGISEQ-2000和DNBSEQ-T7上實現(xiàn)測序分析



DNBSEQ因其具有重復(fù)率(Duplicate rate)低、有效數(shù)據(jù)利用率高的突出優(yōu)勢,特別適合周血、ctDNA這類相對濃度低且背景復(fù)雜型樣本的高深度測序分析,進一步提高測序的經(jīng)濟性,降低患者連續(xù)監(jiān)測多次檢測的經(jīng)濟負擔,有助于MRD檢測的普及。此外,DNBSEQ平臺也提供了完整的“WES+個性化定制Panel“的技術(shù)方案,目前DNBSEQ平臺已實現(xiàn)對市售主流WES產(chǎn)品的全適配,加之另一個核心技術(shù)——“ATOPlex 多重PCR靶向測序定制平臺”,可實現(xiàn)從腫瘤組織WES檢測、個性化Panel設(shè)計和訂購(基因位點在線提交——自動化設(shè)計——標準化生產(chǎn)——質(zhì)檢和交付)到ctDNA-MRD監(jiān)測的全過程。




在DNBSEQ賦能生態(tài)伙伴開發(fā)產(chǎn)品的同時,華大智造希望與生態(tài)伙伴一起推動ctDNA-MRD的臨床使用和普及。5月19日,臻和生物和華大智造聯(lián)合舉辦的“共話精準”系列專家交流會-華南區(qū)首場,在云端如期舉行,來自兩廣多家醫(yī)院的胸外科肺癌專家就LUNGCA-1研究和ctDNA-MRD檢測對肺癌術(shù)后治療決策的臨床應(yīng)用價值展開了熱烈的討論,大家一起就“如何篩選和推薦I期NSCLC患者進行MRD檢測”“怎么平衡過渡檢測與患者檢測價值” 等關(guān)注的議題進行了深入的交流,在認可MRD價值的同時也共同期待后續(xù)有更多臨床研究成果和證據(jù)的出現(xiàn),幫助改善患者的生存獲益。




參考文獻:1. L Xia, J Mei, R Kang, S Deng et al. Perioperative ctDNA-Based Molecular Residual Disease Detection for Non–Small Cell Lung Cancer: A Prospective Multicenter Cohort Study (LUNGCA-1). Clin Cancer Res. 2021 Nov 29.2. JT Zhang, SY Liu, W Gao et al. Longitudinal Undetectable Molecular Residual Disease Defines Potentially Cured Population in Localized Non–Small Cell Lung Cancer. Cancer Discovery, 11 May 2022:OF1-OF12.3. Use of Circulating Tumor Deoxyribonucleic Acid for Early-Stage Solid Tumor Drug Development; Draft Guidance for Industry; Availability. Docket Number: Docket No. FDA-2022-D-0084.


DNBSEQ開發(fā)伙伴,共建產(chǎn)業(yè)生態(tài)

作為測序行業(yè)的上游設(shè)備提供商,華大智造始終致力于為用戶提供更強大的生產(chǎn)工具,通過構(gòu)建開放平臺,與業(yè)內(nèi)伙伴共同促進高通量測序行業(yè)蓬勃發(fā)展。

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