2023年1月8日起，我國對新型冠狀病毒感染實施“乙類乙管”。新冠疫情防控進入新階段，國家疾控部門進一步完善新冠病毒變異監(jiān)測的工作方案，在本土病例監(jiān)測方面，每個省選擇了部分的城市和醫(yī)院作為監(jiān)測哨點，對門診病例、重癥和死亡病例開展一定數(shù)量的新冠病毒感染病例的采樣和序列測定。

近日，廣州醫(yī)科大學(xué)附屬市八醫(yī)院（以下簡稱廣州市八醫(yī)院）作為”入境患者定點收治醫(yī)院“，一直動態(tài)監(jiān)測新冠病毒變異的趨勢，基于華大智造的MGISEQ-2000基因測序儀、ATOPlex RNA多重PCR建庫試劑盒套裝V3.1以及MetargetCOVID軟件，在收治的境外輸入新冠病毒感染者中檢測出了BQ.1.25、XBB.1、XBB.2等奧密克戎亞型變異毒株。

測序報告顯示測出BQ.1.25、XBB.1 、XBB.2變異毒株

華大智造MGISEQ-2000是一款靈活高效的測序平臺，搭配2種通量的載片：大載片（FCL）和小載片（FCS），可獨立上機，單次運行數(shù)據(jù)產(chǎn)量可從55Gb到1,440Gb。ATOPlex RNA多重PCR建庫試劑盒套裝V3.1（簡稱ATOPlexV3.1）采用328對混合引物（平均擴增178bp）來捕獲新冠病毒全基因組序列信息，對于低濃度、易降解的樣本友好、具有極高的靈敏度。而MGI MetargetCOVID軟件支持批量樣本的快速分析，可實現(xiàn)新冠病毒的準確分型。

基于華大智造MGISEQ-2000、ATOPlexV3.1及MetargetCOVID軟件的測序組合，廣州市八醫(yī)院單次完成96*個新冠樣本的測序工作，得到病毒序列全長覆蓋率達到99%以上，測序效率高，測序結(jié)果質(zhì)量優(yōu)異。

廣州市八醫(yī)院工作人員在華大智造MGISEQ-2000上操作新冠樣本測序早在2021年5月，華大智造啟動為廣州市八醫(yī)院提供新冠病毒測序工具。2021年5月21日至2021年6月18日，廣州市八醫(yī)院共確診159例新冠Delta毒株病例，廣州市八醫(yī)院聯(lián)合廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院等單位采用華大智造的ATOPlex技術(shù)平臺和MGISEQ-2000測序儀的測序組合產(chǎn)品成功實現(xiàn)對新冠Delta病毒全基因組的測序、比對、分型和溯源。

廣州市八醫(yī)院工作人員使用MGI MetargetCOVID軟件進行樣本毒株分型廣州醫(yī)科大學(xué)附屬市八醫(yī)院傳染病研究所主任李鋒表示：“在監(jiān)測哨點開展新冠病毒全基因組測序，能夠及時動態(tài)掌握人群感染發(fā)病水平和變化趨勢，科學(xué)研判和預(yù)測疫情規(guī)模、強度和流行時間，動態(tài)分析病毒株變異情況。華大智造提供的國產(chǎn)高通量測序工具組合準確、高效、操作簡便，為新冠病毒變異監(jiān)測提供了強大的技術(shù)支撐?！?/span>

近年來，高通量測序技術(shù)在病原的監(jiān)測和溯源以及公共衛(wèi)生事件的應(yīng)對中發(fā)揮著極其重要的作用。華大智造始終致力于成為“生命科技核心工具締造者”，針對醫(yī)療機構(gòu)、公共衛(wèi)生機構(gòu)開展新型冠狀病毒感染疫情監(jiān)測的需求，持續(xù)提供實時、全景、全生命周期的測序產(chǎn)品組合，助力病毒變異監(jiān)測，賦能傳染病防控的“醫(yī)防結(jié)合”。

*MGISEQ-2000基因測序儀單次運行可實現(xiàn)384-3072個新冠樣品的測序。