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行業(yè)標準 | 華大智造參與制定《BRCA基因突變檢測試劑盒及數(shù)據(jù)庫通用技術(shù)要求(高通量測序法)》正式實施!

時間:2023-10-13作者:華大智造閱讀數(shù):4705分享

近日,由國家藥品監(jiān)督管理總局提出,全國醫(yī)用臨床檢驗實驗室和體外診斷系統(tǒng)標準化技術(shù)委員會(SAC/TC136)歸口,中國食品藥品檢定研究院主導牽頭,華大智造等機構(gòu)共同參與制定的《BRCA基因突變檢測試劑盒及數(shù)據(jù)庫通用技術(shù)要求(高通量測序法)》行業(yè)標準(YY/T 1865—2022)于2023年10月1日正式實施。


該標準旨在指導和規(guī)范BRCA基因突變檢測的試劑盒要求、數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)構(gòu)成、數(shù)據(jù)庫的構(gòu)成和規(guī)范、數(shù)據(jù)管理和解讀標準。此標準的建立,將為BRCA基因胚系突變檢測,BRCA基因突變檢測數(shù)據(jù)庫及其質(zhì)量控制提供明確的參考與評估依據(jù),旨在全面評估產(chǎn)品性能、安全性及有效性,進一步為臨床有效性驗證提供堅實標準。



近年來,隨著測序技術(shù)的革命性發(fā)展和“精準醫(yī)學”理念的深入人心,高通量測序技術(shù)已在遺傳性疾病、生殖健康、婦幼保健、腫瘤靶向用藥指導等領(lǐng)域諸多領(lǐng)域展現(xiàn)其獨特的應用價值。


然而,高通量測序產(chǎn)出的大量基因數(shù)據(jù),帶來了更多未知臨床意義變異位點的巨大挑戰(zhàn)和行業(yè)監(jiān)管的難題。在過去,因位點有限、認知局限,研究人員需要通過大量臨床驗證去證明疾病與有限位點的相關(guān)性;基因檢測產(chǎn)品在臨床應用申請上市前,需要經(jīng)過國家藥監(jiān)局的檢測分析性能評估和臨床有效性審查。美國FDA提出對高通量測序檢測申報的分析性能和臨床有效性評估分別頒發(fā)許可,組合應用預期用途,后者可與針對具體臨床應用,F(xiàn)DA認證的行業(yè)標準數(shù)據(jù)庫進行參比得以實現(xiàn)。因此,在中國,通過多相關(guān)方共商共建基因變異標準解讀數(shù)據(jù)庫,進一步為臨床有效性驗證提供參比標準,成為結(jié)果判定有效依據(jù)顯得尤為重要。


如今,隱私計算已逐漸成為促進數(shù)據(jù)融合與價值挖掘的關(guān)鍵技術(shù),但真正實現(xiàn)大規(guī)模生產(chǎn)級別部署運用,依然面臨諸多挑戰(zhàn)。除了計算效率需進一步提升之外,在促進建立多方可信協(xié)作時,如何公平公正地確認和保障各方的數(shù)據(jù)貢獻度和算法權(quán)益,也是推動隱私計算大規(guī)模應用必須解決的問題之一,區(qū)塊鏈+隱私計算或可提供一種思路。區(qū)塊鏈技術(shù)提供的確權(quán)功能,輔以有效的激勵機制,可促進調(diào)動數(shù)據(jù)聯(lián)盟內(nèi)各節(jié)點的參與度,從而促進跨機構(gòu)跨組織的協(xié)作。


在此背景下,區(qū)塊鏈技術(shù)以其分布式賬本架構(gòu),成為確保數(shù)據(jù)安全、確權(quán)存儲的關(guān)鍵技術(shù)。利用智能合約、分布式存儲和點對點加密傳輸?shù)燃夹g(shù)特性,天然適合多方協(xié)作共建數(shù)據(jù)聯(lián)盟的應用場景,有效化解多方共建過程中各參與機構(gòu)競爭與合作的矛盾,輔以隱私保護可信計算,形成了保障多方數(shù)據(jù)聯(lián)盟建立過程中的公平性和透明性解決方案。


2019年,由華大智造提供核心技術(shù)支持,聯(lián)合中國食品藥品檢定研究院等多家領(lǐng)域內(nèi)龍頭企業(yè)參與的 “BRCA基因變異解讀標準數(shù)據(jù)庫“項目正式啟動,基于區(qū)塊鏈技術(shù)搭建分布式聯(lián)盟網(wǎng)絡(luò),以華大基因、吉因加、艾德生物、泛生子、達瑞生物、和瑞基因等多家廠商為機構(gòu)節(jié)點,中檢院為監(jiān)管節(jié)點,建立多方聯(lián)合的BRCA基因變異解讀標準數(shù)據(jù)庫(http://exchange.cngb.org/)。截至目前,已完成5000+數(shù)據(jù)集和50000+位點的元信息鏈上確權(quán)。數(shù)據(jù)聯(lián)盟已薈聚6+遺傳咨詢專家和15+臨床咨詢專家參與位點臨床意義的解讀評審,目前已成為國內(nèi)BRCA變異解讀評價的標準數(shù)據(jù)集。


基于該實踐,2023年10月1日,行業(yè)標準《BRCA基因突變檢測試劑盒及數(shù)據(jù)庫通用技術(shù)要求(高通量測序法)》正式實施。


BRCA基因變異解讀數(shù)據(jù)庫截圖


該標準的正式實施,將有效解決因位點有限、認知局限而導致研究人員需要通過大量臨床驗證去證明疾病與有限位點的相關(guān)性,以及不同變異位點的解讀標準等難題。不僅如此,基于區(qū)塊鏈技術(shù)構(gòu)建的多專家共識評審、數(shù)據(jù)確權(quán)與溯源機制,為高通量測序儀產(chǎn)出的基因數(shù)據(jù)中的大量未知臨床意義變異位點的行業(yè)監(jiān)管提供新的范式。


華大智造作為該標準的共同起草單位,一直致力于積極參與并推動行業(yè)標準的制定與研究。截至2023年6月30日,華大智造已參與制修訂并發(fā)布的標準累計56項,其中國際標準2項,國家標準12項,行業(yè)標準3項,團體標準29項,企業(yè)標準7項,一帶一路標準3項。


標準起草單位:中國食品藥品檢定研究院、深圳華大智造科技股份有限公司、廣州市達瑞生物技術(shù)股份有限公司、北京市醫(yī)療器械檢驗研究院、北京吉因加科技有限公司、深圳華大基因股份有限公司、上海思路迪生物醫(yī)學科技有限公司、廈門艾德生物醫(yī)藥科技股份有限公司、北京泛生子基因科技有限公司、廣州燃石醫(yī)學檢驗所有限公司、福建和瑞基因科技有限公司。


標準主要起草人:曲守方、楊夢、楊學習、李達、易玉婷、王文靖、馬靜、李旭超、黃偉偉、汪浩、白健、邵康、李士森、吳英松、于婷、張文新、黃杰。

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