伴隨去年9月CycloneSEQ納米孔測序技術(shù)的發(fā)布,華大智造作為華大序風(fēng)的全球經(jīng)銷商,成為國內(nèi)首個同時掌握“短讀長”(DNBSEQ測序平臺)與“長讀長”(CycloneSEQ測序平臺)測序工具的機構(gòu),基于長短讀長測序技術(shù)的“雙劍合璧”,構(gòu)建以“全讀長”(SEQ ALL)為目標的全流程工具矩陣。
2025年3月1日,華大智造SEQ ALL聯(lián)盟年度峰會在杭州舉辦,來自不同領(lǐng)域的專家學(xué)者們圍繞“CycloneSEQ+DNBSEQ平臺”在科研、醫(yī)學(xué)及產(chǎn)業(yè)等方向的前沿應(yīng)用進行探討,并分享了多項最新的突破性測試結(jié)果及應(yīng)用成果,全方位展示了華大智造 SEQ ALL 平臺的硬核實力!
國家生物信息中心研究員蔣嵐:通用型高通量單細胞多組學(xué)技術(shù)分享
國家生物信息中心研究員蔣嵐表示,當(dāng)前單細胞測序技術(shù)面臨一些需求及問題,如:該技術(shù)難以應(yīng)對群體尺度的迫切需求、缺乏單細胞多模態(tài)數(shù)據(jù)以及臨床試驗還在最早期階段等。其課題組的嵌入點是希望通過技術(shù)的創(chuàng)新去加速單細胞技術(shù)的大規(guī)模應(yīng)用,從而彌補中間的差距,突破降低液滴微流控的空載率等問題,顯著提升通量,同時數(shù)據(jù)質(zhì)量非常高。
國家生物信息中心研究員蔣嵐
蘇州大學(xué)周哲敏教授:CycloneSEQ-WT02實現(xiàn)染色體及質(zhì)粒近完全環(huán)化
當(dāng)前,基于常規(guī)宏基因組進行的病原檢測流程,病原體檢測的敏感性與特異性不夠,導(dǎo)致難以區(qū)分致病菌與共生菌,且無法解析菌株水平的遺傳特征。蘇州大學(xué)周哲敏教授團隊通過全物種核心基因參考數(shù)據(jù)集,建立了ucgMLST分析流程以整合不同宏基因組流程的整合框架。
基于該分析流程,在極低覆蓋深度的情況下,可實現(xiàn)高質(zhì)量的菌株序列重建和進化分析。進一步將CycloneSEQ-WT02平臺與ucgMLST分析流程結(jié)合,對碳青霉烯耐藥菌進行全基因組測序,可以實現(xiàn)染色體近乎完全環(huán)化(N50達4.9 Mb),并在重建的83質(zhì)粒中實現(xiàn)98.8%環(huán)化率。WT02與ucgMLST流程結(jié)合,還可精準構(gòu)建細菌進化樹,其結(jié)果與二代測序高度一致,為混合感染溯源和耐藥傳播機制研究提供了高分辨率的分子證據(jù)。
蘇州大學(xué)教授周哲敏
中科院深??茖W(xué)與工程研究所研究員李海松:CycloneSEQ+DNBSEQ解密海洋哺乳動物基因組
海洋哺乳動物作為研究哺乳動物水生適應(yīng)性的獨特模型,其基因組結(jié)構(gòu)變異與種群分化機制長期缺乏高精度數(shù)據(jù)支撐。中國科學(xué)院李松海研究團隊利用T1+和G400-ER平臺完成多個海洋哺乳動物全基因組測序,該研究明確了不同種群間的遺傳分化特征,為水生適應(yīng)性演化研究與保護策略優(yōu)化提供了分子基石。
中科院深??茖W(xué)與工程研究所研究員李海松
中國農(nóng)業(yè)大學(xué)教授胡曉湘:T1+和T7測序組合助力全球雞基因字典研究
中國農(nóng)業(yè)大學(xué)教授胡曉湘強調(diào)在海量數(shù)據(jù)中學(xué)習(xí)深層規(guī)律:不僅適用于人類語言,也適配基因組語言。目前已經(jīng)做完了全球雞基因組字典的初步工作?;蜃值淇梢灾苯討?yīng)用于商業(yè)化肉雞群體的遺傳選育,低深度重測序技術(shù);同時可以利用基因字典進行GWAS研究。基于華大智造DNBSEQ-T7及T1+建立了高通量測序技術(shù)平臺,執(zhí)行百萬級樣本的重測序任務(wù)。
中國農(nóng)業(yè)大學(xué)教授胡曉湘
澳門大學(xué)副教授劉子銘:T1+助力單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)
澳門大學(xué)副教授劉子銘表示課題組通過做組織的虛擬切片,在不用染色的情況下探索免疫和血管與腫瘤之間的互動關(guān)系??梢暬笠部梢詫︻惼鞴僮鏊幮恿Φ脑u價,看到DNA的熒光報道DNA在空間的分布。T1+測序儀能快速且正確的完成空間轉(zhuǎn)錄文庫的測序工作,通過膜染色的轉(zhuǎn)基因動物模型可以展示細胞邊界,精準并稀疏的轉(zhuǎn)錄組信息,加速下游的降維聚類等分析,期待未來實現(xiàn)單細胞分辨率的細胞注釋。
澳門大學(xué)副教授劉子銘
杭州華大生命科學(xué)研究院研究員陳亮:CycloneSEQ單細胞全長轉(zhuǎn)錄組測序揭示發(fā)育調(diào)控本質(zhì)
單細胞轉(zhuǎn)錄組的異構(gòu)體復(fù)雜性,一直是發(fā)育生物學(xué)和疾病研究的核心挑戰(zhàn)。華大生命科學(xué)研究院陳亮團隊基于CycloneSEQ平臺開發(fā)了單細胞全長轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),有效數(shù)據(jù)得率與長短讀長一致性均達國際領(lǐng)先水平。基于CycloneSEQ單細胞全長轉(zhuǎn)錄組的測序技術(shù)可對細胞進行更加細微特征的捕獲以及細胞分群,對基因表達的復(fù)雜性進行評判還可揭示細胞異質(zhì)性,研究細胞特異性的調(diào)控機制。
進一步,基于該檢測平臺,陳亮團隊在斑馬魚胚胎發(fā)育研究中,通過CycloneSEQ單細胞全長轉(zhuǎn)錄組測序平臺精細描繪了細胞間異質(zhì)性、動態(tài)轉(zhuǎn)錄本使用模式以及可變剪接事件在斑馬魚早期胚胎發(fā)育進程的重要調(diào)控作用,為理解早期發(fā)育關(guān)鍵過程提供了全新視角。
杭州華大生命科學(xué)研究院研究員陳亮
深圳華大基因股份有限公司技術(shù)總監(jiān)唐沖博士:T1+助力院端檢測快速交付
深圳華大基因股份有限公司技術(shù)總監(jiān)唐沖博士分享了T1+可以兼容多種文庫類型,同時兼具3種規(guī)格芯片、集成了生信模塊以及測序速度相較于MGISEQ-2000有極大的提升。在醫(yī)學(xué)應(yīng)用上測試了多種樣本,做一致性檢出情況時基本可以達到100%的一致性檢出,整體上非常符合預(yù)期。在院端T1+搭配自動化設(shè)備DNBelab-D4實現(xiàn)快速交付,樣本進,報告出。
深圳華大基因股份有限公司技術(shù)總監(jiān)唐沖
北京吉因加科技有限公司基因研究院副院長劉濤:T1+助力吉因加腫瘤檢測全流程
北京吉因加科技有限公司基因研究院副院長劉濤介紹到,現(xiàn)在吉因加已全部實現(xiàn)NGS整體解決方案國產(chǎn)化, 此次對T1+測序儀的驗證實驗采用了多款腫瘤領(lǐng)域的核心應(yīng)用進行了聯(lián)合測試,T1+在測序數(shù)據(jù)準確性上有明顯提升。從腫瘤用藥的應(yīng)用檢測結(jié)果對比來看不僅突變形態(tài)完全一致,檢出的突變等位基因頻率百分之百一致??偨Y(jié)來看,T1+平臺是一個穩(wěn)定可靠、性能卓越,臨床檢測結(jié)果安全有效的優(yōu)秀的測序平臺,吉因加對T1+平臺在未來的臨床應(yīng)用中表現(xiàn)也充滿了期待。
北京吉因加科技有限公司基因研究院副院長劉濤
南京世和基因生物技術(shù)股份有限公司高級研究員蔣文:更快速、簡便、準確,T1+助力腫瘤檢測
南京世和基因生物技術(shù)股份有限公司高級研究員蔣文首先介紹了T1+在測序速度、操作簡便性、測序準確性提升,同時針對T1+做了多種應(yīng)用的測試,T1+相較于MGISEQ-2000縮短了近50%的測序時間,實際產(chǎn)出和測序質(zhì)量上T1+也有很高的提升,錯誤率上相比于MGISEQ-2000,T1+有比較大的下降,世和認為T1+可以適用于panel測序的腫瘤檢測產(chǎn)品,也希望T1+可以在未來的腫瘤檢測當(dāng)中發(fā)揮其真正的作用。
南京世和基因生物技術(shù)股份有限公司高級研究員蔣文
CycloneSEQ+DNBSEQ:
讓“全讀長”成為科研標配
此次在會上亮相的兩顆“SEQ ALL新星”——G400-ER及T1+,分別代表CycloneSEQ平臺與DNBSEQ平臺,為用戶再次帶來突破性創(chuàng)新與升維式體驗。
G400-ER填補了國內(nèi)納米孔測序領(lǐng)域高通量芯片的空白,多項關(guān)鍵性能處于全球領(lǐng)先的水平,是全球單芯片設(shè)計通量最高的納米孔長讀長測序儀。它采用高密度納米孔芯片設(shè)計,數(shù)據(jù)產(chǎn)出速率可達每分鐘100Mb,支持100bp~Mb級別讀長,高效靈活,隨測隨停、按需開機;它還能夠高效精準檢測復(fù)雜基因組,并同步檢測堿基修飾。G400-ER超長讀長、高數(shù)據(jù)產(chǎn)出和實時測序的性能,使其適用于全基因組重測序、動植物基因組檢測、宏基因組測序、單細胞全長轉(zhuǎn)錄組測序等多種應(yīng)用場景。
納米孔測序儀G400-ER
作為DNBSEQ “十周年禮”的旗艦機型,T1+不僅是全球首款可在24小時內(nèi)產(chǎn)出Tb級別數(shù)據(jù)的桌面式測序儀,也是全球日生產(chǎn)速度最快的桌面式Tb級測序儀。它與T7、G99、E25一起組成了DNBSEQ測序儀的“極速全家桶”,實現(xiàn)從Gb級至Tb級不同通量均支持24小時內(nèi)交付數(shù)據(jù),全面開啟測序「天」時代。
T1+以更快速,更靈活、更易用的方式,推動行業(yè)進入“文庫上機、數(shù)據(jù)當(dāng)日達”的時代。它是速度更快的“全能王”,單次通量覆蓋25Gb-1.2Tb,能夠在24小時內(nèi)一鍵完成DNA文庫的PE150測序任務(wù),完成SE50測序最多只需7小時;它支持1~2張載片獨立運行以及不同測序讀長需求,PE150級測序的Q40>90%;它“一鍵啟動,一氣呵成”,首次將DNB制備功能集成到設(shè)備內(nèi)部,支持多種類型的上機文庫(dsDNA、ssCirDNA、DNB)。“一機多用”的T1+,不僅能夠滿足廣泛應(yīng)用領(lǐng)域的需求,更能支持 “一個人”的多組學(xué)研究。
桌面式Tb級測序儀T1+
基于“CycloneSEQ+DNBSEQ”平臺,華大智造實現(xiàn)為全球用戶提供 SEQ ALL 全流程工具。未來,華大智造及華大序風(fēng)將繼續(xù)攜手,發(fā)揮各自所長,持續(xù)推動基因測序通量、速度、讀長、準確率及測序成本等各個關(guān)鍵指標突破,讓基因測序更可及、讓生命皆可測。