進(jìn)入秋冬季節(jié)以來，我國急性呼吸道疾病持續(xù)上升。監(jiān)測顯示，呼吸道感染性疾病的病原以流感病毒為主，此外還有鼻病毒、肺炎支原體、呼吸道合胞病毒、腺病毒等，呈多種呼吸道病原體疊加態(tài)勢(shì)。多病原監(jiān)測結(jié)果提示，不同年齡群體流行的主要病原體不同；不同地區(qū)省份的呼吸道傳染病流行強(qiáng)度和周期也不同。高效準(zhǔn)確地進(jìn)行多病原檢測與監(jiān)測對(duì)于呼吸道疾病的治療和防控至關(guān)重要。

江漢大學(xué)彭海教授團(tuán)隊(duì)基于華大智造DNBSEQ-G99測序平臺(tái)，開發(fā)了呼吸道多病原鑒定MNP標(biāo)記技術(shù)，可同時(shí)監(jiān)測132種呼吸道病原體，并精細(xì)溯源至單堿基變異。2022年-2023年，江漢大學(xué)與湖北省疾控中心聯(lián)合探索性開展MNP技術(shù)在傳染病領(lǐng)域的應(yīng)用研究，并分別在武漢、恩施、咸寧等地市疾控機(jī)構(gòu)和醫(yī)療機(jī)構(gòu)開展呼吸道多病原鑒定MNP標(biāo)記技術(shù)的試點(diǎn)應(yīng)用，采用“多病同防”策略進(jìn)行病原體精準(zhǔn)識(shí)別，提升了全省秋冬季傳染病防控工作技術(shù)水平。

圖1 .MNP技術(shù)原理及測序分析流程

12月25日，呼吸道多病原鑒定MNP標(biāo)記技術(shù)負(fù)責(zé)人、江漢大學(xué)高利芬博士，在華大智造第六期DNBSEQ-G99線上分享會(huì)上進(jìn)行了《基于DNBSEQ測序平臺(tái)的MNP技術(shù)在多病原鑒定中的應(yīng)用》的報(bào)告，MNP技術(shù)發(fā)明人江漢大學(xué)彭海教授參與了線上的技術(shù)交流和答疑。

傳統(tǒng)的多病原監(jiān)測方法只能監(jiān)測幾種到十余種病原體，并且只能判斷病原體的有無，難以監(jiān)測病原體流行演變。MNP病原譜監(jiān)測技術(shù)面向流行病監(jiān)測需求開發(fā)，不僅能全面、精準(zhǔn)和靈敏的檢測病原體的有無，還能滿足病原體定量、精細(xì)溯源等特殊需求。

圖2. MNP標(biāo)記技在術(shù)DNBSEQ-G99平臺(tái)的檢測、定量性能重復(fù)性測試

目前，該技術(shù)已經(jīng)完成在DNBSEQ-G99測序平臺(tái)的適配，并進(jìn)行了多輪真實(shí)樣本測試，表現(xiàn)出良好的病原體鑒定準(zhǔn)確性、定量能力和溯源能力。DNBSEQ-G99是中小通量領(lǐng)域測序速度最快機(jī)型之一，可以在12小時(shí)完成PE150讀長測序，極大地提升了MNP標(biāo)記技術(shù)的使用效率，同時(shí)特有的多時(shí)點(diǎn)數(shù)據(jù)輸出模式（bioanalysis by sequencing, BBS)，可實(shí)現(xiàn)病原快速識(shí)別，節(jié)省寶貴的防控時(shí)間。

圖3 .MNP標(biāo)記檢出的病原變異與進(jìn)化分析

秉承“創(chuàng)新智造引領(lǐng)生命科技”的理念，在公共衛(wèi)生領(lǐng)域，華大智造已形成病原微生物宏基因組測序、靶向測序、全基因組測序等應(yīng)用場景的全流程產(chǎn)品組合，滿足新冠病毒、流感病毒、猴痘病毒、登革熱病毒等病原微生物全基因組測序和溯源需求，持續(xù)助力傳染病防控和公共衛(wèi)生能力建設(shè)。

未來，華大智造還將繼續(xù)聯(lián)合行業(yè)研究機(jī)構(gòu)與企業(yè)生態(tài)伙伴，不斷拓展DNBSEQ測序技術(shù)在病原微生物研究和傳染病防控領(lǐng)域的應(yīng)用場景，為公共衛(wèi)生事件的監(jiān)測和預(yù)警提供更自動(dòng)、更便捷、更高效的自主核心工具。