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單細胞研究新篇章:MGIEasy組織保存液與升級版單細胞3’RNA文庫制備試劑全新發(fā)布

時間:2024-03-29作者:華大智造閱讀數(shù):4332分享

2024年3月29日,華大智造在第二屆國際單細胞及空間組學大會上,正式發(fā)布其單細胞領域的最新產(chǎn)品MGIEasy組織保存液,以及全新升級的3’RNA-V3.0文庫制備試劑盒。也意味著,華大智造DNBelab C系列單細胞產(chǎn)品家族迎來樣本處理環(huán)節(jié)新成員,可護航珍貴樣本在72h內(nèi)保持基因表達完整性。此外,歷經(jīng)6年,三代產(chǎn)品迭代,此次也迎來了性能極致優(yōu)化的3’RNA文庫制備試劑盒V3.0。


圖1. MGIEasy組織保存液及3’RNA-V3.0文庫制備試劑盒


MGIEasy組織保存液的發(fā)布填補了華大智造在樣本保存環(huán)節(jié)的試劑空白,進一步為單細胞研究者提供了更完善的一站式單細胞工具,滿足單細胞研究發(fā)現(xiàn)過程中的全部濕實驗環(huán)節(jié)和數(shù)據(jù)處理流程。



圖2. 華大智造單細胞系列產(chǎn)品全流程一站式平臺



MGIEasy組織保存液全新上市


產(chǎn)品簡介

該組織保存液可以用于新鮮組織樣本的低溫存儲和運輸,在低溫(2-8℃)條件下,可在72h內(nèi)維持新鮮離體組織的細胞活性和穩(wěn)定組織中的基因表達水平;保存的組織可以用于制備高質(zhì)量的單細胞懸液,可應用于單細胞測序、細胞培養(yǎng)等;


產(chǎn)品特點


  • 在2-8℃,72h內(nèi)穩(wěn)定維持新鮮組織的細胞活性;
  • 快速滲透新鮮的組織樣本,減少離體后組織基因表達的變化;
  • 有效避免收集多個樣本時的批間差異;
  • 適配單細胞測序技術產(chǎn)出高質(zhì)量數(shù)據(jù);



圖3. MGIEasy組織保存液



實測數(shù)據(jù)


圖4. 組織保護液處理72h后小鼠多個組織解離細胞活率


表1. 小鼠脾臟為例組織保存液處理不同時間細胞質(zhì)量和數(shù)量


圖5. 使用RT-qPCR方法分析小鼠9個組織的8個應激相關的基因檢測


圖6. 組織保存液用于單細胞測序技術



單細胞3’RNA文庫制備試劑盒V3.0

全新升級


產(chǎn)品簡介

在單細胞產(chǎn)品領域,華大智造在2019年率先發(fā)布了DNBelab C系列產(chǎn)品,已收獲了眾多企業(yè)及科研用戶的好評。2023年7月,華大智造發(fā)布了單細胞液滴生成儀DNBelab C-TaiM 4,為細胞或細胞核的分離和標簽提供穩(wěn)定的動力。


今天,在多組學建庫方面,華大智造開發(fā)了第三代3’RNA文庫制備試劑盒,試劑盒套裝包括液滴生成、高通量文庫制備、樣本標簽和加樣載片共4個模塊,5個子盒,產(chǎn)品性能得到了極大提升,單載片最多可以捕獲2萬個細胞,基因中位數(shù)PBMC、鼠腦細胞核等樣本均可以達到2500。


圖7. DNBelab C系列 高通量單細胞RNA文庫制備試劑盒套裝V3.0組成


圖8. DNBelab C系列 高通量單細胞RNA文庫制備試劑盒套裝V3.0性能


升級亮點


  • 基因檢出多,以PBMC為例提升60%以上,小鼠腦細胞核為例提升2倍以上;
  • 樣本兼容廣,低質(zhì)量細胞、細胞核、原生質(zhì)體均能產(chǎn)出良好數(shù)據(jù);
  • 易用穩(wěn)定,去掉繁瑣的真空破乳和磁珠回收步驟,節(jié)省時間2h;
  • 經(jīng)濟友好,有效數(shù)據(jù)更多,測序需求的成本下降20%;



數(shù)據(jù)表現(xiàn)



圖9. 部分樣本數(shù)據(jù)表現(xiàn)


表2. PBMC樣本升級前后對比



圖10. PBMC升級前后基因和中位數(shù)對比(可以注釋更多的中性細胞)


平臺的重復實驗穩(wěn)定



圖11. 人PBMC和鼠腦細胞核樣本的重復實驗


平臺對比

與某海外平臺對比,選取植物原生質(zhì)體和哺乳動物肌肉細胞核為例,在細胞捕獲效率上相當,均在50%以上,華大智造TaiM 4-V3.0版本在測序數(shù)據(jù)量更少的前提下,可以檢測出更多的基因;人胃癌樣本(數(shù)據(jù)來源吉因加)為例,和某主流平臺細胞注釋種類和比例高度一致,和某物種肌肉樣本為例對比,可以檢出更多低豐度基因和注釋出更多細胞類型。



圖12. 和某國際主流平臺對比


值得一提的是,截至目前,基于華大智造單細胞平臺,累計發(fā)表SCI論文65篇。其中,包含2篇Nature及2篇Cell主刊文章。



總結


華大智造副總裁、中國區(qū)總經(jīng)理彭歡歡表示,華大智造推出單細胞領域新品——MGIEasy組織保存液,以及全新升級的3’RNA-V3.0文庫制備試劑盒,將進一步完善了華大智造單細胞組學全流程產(chǎn)品家族,也將高效賦能全球生命科學實驗室開啟規(guī)?;?、標準化的單細胞多組學研究。



圖13. 華大智造副總裁、中國區(qū)總經(jīng)理彭歡歡


未來,華大智造作為生命科技核心工具締造者,將進一步深耕單細胞組學領域,致力于為所有生命科學實驗室提供便攜、經(jīng)濟、操作友好的單細胞組學全流程產(chǎn)品,助力行業(yè)開啟大規(guī)模單細胞研究新時代。

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