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賦能科研丨基于華大智造單細(xì)胞建庫和測序平臺(tái),同濟(jì)大學(xué)多個(gè)團(tuán)隊(duì)合作揭示W(wǎng)olfram綜合征致病機(jī)制

時(shí)間:2024-05-14作者:華大智造閱讀數(shù):3218分享

2024年2月6日,同濟(jì)大學(xué)附屬東方醫(yī)院再生醫(yī)學(xué)研究所、心臟病學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室及醫(yī)學(xué)創(chuàng)新中心、同濟(jì)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院、教育部“細(xì)胞干性與命運(yùn)編輯”前沿科學(xué)中心、上海市信號與疾病研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室李維達(dá)/張振寧和東方醫(yī)院邵莉團(tuán)隊(duì)在國際學(xué)術(shù)期刊Cell Death & Differentiation 上發(fā)表題為ISR inhibition reverses pancreatic β-cell failure in Wolfram syndrome models 的研究成果。


該研究對WFS1缺失的人類胚胎干細(xì)胞進(jìn)行誘導(dǎo)分化并得到干細(xì)胞來源的胰島,利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)研究了致病基因WFS1對胰島β細(xì)胞的影響,并發(fā)現(xiàn)ISR抑制劑ISRIB能緩解WFS1缺失的胰島β細(xì)胞的功能衰竭,且在WFS1條件性敲除小鼠中也能發(fā)揮作用。


此研究為治療WS糖尿病提供了新的藥物選項(xiàng)。研究者在先前的工作中發(fā)現(xiàn)了一種藥物Riluzole,它能夠逆轉(zhuǎn)與WS神經(jīng)病變相關(guān)的神經(jīng)元喪失和突觸形成異常。未來,將Riluzole與ISRIB結(jié)合將有望實(shí)現(xiàn)WS協(xié)同治療。該研究中的單細(xì)胞測序基于華大智造DNBelab C系列單細(xì)胞建庫平臺(tái)和DNBSEQ測序平臺(tái)。



文章題目:ISR inhibition reverses pancreatic β-cell failure in Wolfram syndrome models

發(fā)表時(shí)間:2024-2-6

發(fā)表期刊:Cell Death & Differentiation

主要研究團(tuán)隊(duì):同濟(jì)大學(xué)附屬東方醫(yī)院再生醫(yī)學(xué)研究所、心臟病學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室及醫(yī)學(xué)創(chuàng)新中心、同濟(jì)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院、教育部“細(xì)胞干性與命運(yùn)編輯”前沿科學(xué)中心、上海市信號與疾病研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、和東方醫(yī)院等

影響因子:12.4

DOI:10.1038/s41418-024-01258-w



研究背景


Wolfram綜合征(Wolfram Syndrome, WS)是一種罕見的常染色體隱性遺傳病,許多患者過早死亡,其特征包括青少年糖尿病、視神經(jīng)萎縮、尿崩癥、聽力喪失和神經(jīng)退行性疾病等,糖尿病常為首發(fā)疾病。然而,由于缺乏合適的人類模型,Wolfram綜合癥的致病機(jī)制尚不明確,導(dǎo)致目前尚無治療方法可延緩、停止或逆轉(zhuǎn)Wolfram綜合征的發(fā)展,因此迫切需要新的Wolfram綜合癥模型進(jìn)行深度探索。



研究成果


研究人員首先構(gòu)建了干細(xì)胞來源的胰島(stem cell islets, SC-islets)模型。應(yīng)用CRISPR/Cas9技術(shù)生成WFS1敲除的人類胚胎干細(xì)胞,并對其進(jìn)行誘導(dǎo)分化。研究人員通過qPCR驗(yàn)證了在整個(gè)分化過程中WFS1基因的表達(dá)水平,其與人原代胰腺β細(xì)胞中的表達(dá)水平一致,且可以誘導(dǎo)分化至成熟的干細(xì)胞β細(xì)胞(stem cell-β cells, SC-β cells)。進(jìn)一步,研究人員對WT和WFS1缺失 SC-Islets進(jìn)行了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序,鑒定得到8種細(xì)胞類型,其中包括β細(xì)胞、α細(xì)胞、δ細(xì)胞、ε細(xì)胞、胰腺前體細(xì)胞、增殖細(xì)胞、EC細(xì)胞,以及多激素內(nèi)分泌細(xì)胞。以上結(jié)果表明SC-Islets模型真實(shí)可靠。



圖1  WFS1缺失的SC-islets模型構(gòu)建和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序分析


為探究WFS1對SC-β細(xì)胞的影響,研究人員利用擬時(shí)序分析以模擬SC-β細(xì)胞命運(yùn),發(fā)現(xiàn)WFS1敲除使SC-β細(xì)胞走向壓力應(yīng)激命運(yùn),而未能走向成熟命運(yùn)。研究人員對其進(jìn)行差異表達(dá)分析,發(fā)現(xiàn)WFS1敲除的SC-β細(xì)胞中,與β細(xì)胞成熟和功能相關(guān)的基因表達(dá)下調(diào),而與細(xì)胞應(yīng)激相關(guān)的基因表達(dá)上調(diào)。為驗(yàn)證上述結(jié)果,研究人員進(jìn)行了GSIS實(shí)驗(yàn),并對胰島素含量進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)WFS1敲除的SC-β細(xì)胞胰島素分泌含量顯著降低,且胰島素含量也顯著降低。



圖2  擬時(shí)序分析以模擬SC-β細(xì)胞命運(yùn)、GSIS實(shí)驗(yàn)和胰島素含量檢測


為了進(jìn)一步研究WFS1缺失是如何影響SC-β細(xì)胞走向壓力命運(yùn)進(jìn)而導(dǎo)致功能衰竭,研究人員分析差異表達(dá)基因及其對應(yīng)通路,并通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),WFS1敲除會(huì)使eIF2α的磷酸化顯著增加,PERK和ATF4的蛋白水平也顯著增強(qiáng),且會(huì)促進(jìn)應(yīng)激顆粒 (Stress granules, SGs) 的形成。以上結(jié)果表明WFS1缺失將會(huì)激活胞內(nèi)的整合應(yīng)激反應(yīng) (Integrated stress response, ISR)。




圖3 WFS1缺失激活胞內(nèi)的整合應(yīng)激反應(yīng)


針對上述致病機(jī)制,研究人員探究了ISR抑制劑ISRIB對于胰島β細(xì)胞的治療效果,發(fā)現(xiàn)ISRIB確實(shí)能緩解SC-β細(xì)胞中的功能衰竭。ISRIB的加入能夠有效恢復(fù)總蛋白質(zhì)合成水平,減少應(yīng)激顆粒的形成。此外,在WFS1基因條件性敲除小鼠中加入ISRIB,小鼠的葡萄糖耐受能力得到顯著提升。



圖4 ISR抑制劑ISRIB對于胰島β細(xì)胞治療效果的機(jī)制研究和藥物驗(yàn)證示意圖


綜上,研究人員利用Wolfram綜合癥體外和體內(nèi)模型,揭示了ISRIB在緩解胰島β細(xì)胞功能衰竭中所發(fā)揮的作用,為Wolfram綜合癥的治療提供了新思路。同濟(jì)大學(xué)附屬東方醫(yī)院再生醫(yī)學(xué)研究所、心臟病學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室及醫(yī)學(xué)創(chuàng)新中心、同濟(jì)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院、教育部“細(xì)胞干性與命運(yùn)編輯”前沿科學(xué)中心、上海市信號與疾病研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室李維達(dá)教授,東方醫(yī)院邵莉教授,同濟(jì)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院張振寧副教授為本文共同通訊作者。同濟(jì)大學(xué)博士后胡瑞,同濟(jì)大學(xué)博士生陳相宜,蘇強(qiáng)為本文共同第一作者。


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