6月28日,華大智造與時空組學(xué)相關(guān)業(yè)務(wù)主體達(dá)成合作,將獲得時空組學(xué)產(chǎn)品的知識產(chǎn)權(quán)授權(quán)與全球市場經(jīng)銷權(quán),為生命科學(xué)領(lǐng)域提供更豐富的核心工具。華大智造將負(fù)責(zé)制造并對外銷售時空自動化樣本處理系統(tǒng)、顯微鏡、時空可視化試劑套裝,并成為時空組學(xué)試劑盒、芯片等試劑耗材產(chǎn)品的全球經(jīng)銷商。即日起,時空組學(xué)產(chǎn)品在華大智造同步開放訂購!
近日,“創(chuàng)芯不止·探索無限”時空組學(xué)FFPE產(chǎn)品發(fā)布會成功舉行。時空組學(xué)主任科學(xué)家廖莎正式發(fā)布了時空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案,時空組學(xué)專項科學(xué)家張佳君在發(fā)布會現(xiàn)場啟動了“見‘微’知著——華大時空組學(xué)中國區(qū)青年科學(xué)家激勵計劃”。
來自上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院病理科副主任醫(yī)師笪倩、中南大學(xué)湘雅醫(yī)院特聘副研究員張冠雄、中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院消化內(nèi)科李曉智博士等行業(yè)專家,分享了時空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案在腫瘤、宿主及微生物互作等方向上的前沿應(yīng)用。
與會嘉賓
華大生命科學(xué)研究院副院長方曉東為本次發(fā)布會致辭。他指出,技術(shù)革新是社會發(fā)展的引擎,時空組學(xué)技術(shù)為生命科學(xué)領(lǐng)域創(chuàng)新發(fā)展提供了引擎。本次發(fā)布的時空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案,創(chuàng)新之處在于其隨機(jī)引物技術(shù),它不僅能捕獲宿主RNA,還能捕獲微生物RNA,為深入探索宿主與微生物的相互作用提供了強(qiáng)大工具。最后,他期待能夠攜手更多科研機(jī)構(gòu),共同推動科技創(chuàng)新,促進(jìn)科學(xué)發(fā)展,將科技的福祉帶給全人類。
華大生命科學(xué)研究院副院長方曉東
開辟病理研究新維度
工欲善其事,必先利其器。自2020年發(fā)布了具有“納米級分辨率”與“厘米級全景視場”等突破性優(yōu)勢的時空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq,華大時空組學(xué)持續(xù)基于科研應(yīng)用場景和用戶需求,陸續(xù)推出了時空轉(zhuǎn)錄組+H&E染色、時空轉(zhuǎn)錄組兼容多重免疫熒光、時空蛋白轉(zhuǎn)錄組Stereo-CITE等產(chǎn)品解決方案,進(jìn)一步完善時空組學(xué)技術(shù)在科研領(lǐng)域的全鏈條賦能能力,加速生命科學(xué)研究領(lǐng)域的突破創(chuàng)新。
福爾馬林固定的石蠟包埋(Formalin-Fixed Paraffin Embedded,F(xiàn)FPE)樣本因其易于保存且能較好地保存樣本組織形態(tài)的特點,在全球醫(yī)學(xué)與科研領(lǐng)域被廣泛應(yīng)用。然而FFPE樣本制備過程中,RNA可能存在降解,這導(dǎo)致Poly T探針無法捕獲,且靶向探針的應(yīng)用場景受限,因此亟需新的技術(shù)方法探究FFPE樣本的組學(xué)奧秘。
本次發(fā)布的時空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案,利用“隨機(jī)探針”對FFPE樣本中組織細(xì)胞內(nèi)的Total RNA分子進(jìn)行原位捕獲,并通過空間條形碼(Coordinate ID,CID)還原回空間位置,可實現(xiàn)全物種全轉(zhuǎn)錄組空間表達(dá)圖譜的構(gòu)建。
時空組學(xué)主任科學(xué)家廖莎,在發(fā)布會上展示了時空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案的技術(shù)性能及優(yōu)勢。該產(chǎn)品可在同一張切片上實現(xiàn)H&E染色/細(xì)胞核染色和基因表達(dá)分析。結(jié)合納米級捕獲分辨率的優(yōu)勢,利用StereoMap可視化分析工具,用戶可進(jìn)行真正的空間單細(xì)胞水平分析。同時,全新的StereoMap還支持第三方細(xì)胞分割工具,以滿足復(fù)雜且多樣化的科學(xué)研究需求。
時空組學(xué)主任科學(xué)家廖莎
此外,與常見轉(zhuǎn)錄組方案相比,時空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案還可捕獲發(fā)生降解的RNA片段,也能實現(xiàn)編碼及非編碼RNA的共捕獲,以及宿主與微生物的共檢測。
拓展多元科研應(yīng)用場景
時空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案可應(yīng)用在疾病研究、細(xì)胞圖譜、生物標(biāo)志物研究、宿主與微生物互作研究、非編碼RNA調(diào)控研究等領(lǐng)域。本次發(fā)布會上,來自行業(yè)內(nèi)的三位專家分享了該產(chǎn)品方案在腫瘤、宿主及微生物互作等方向上的前沿應(yīng)用。
上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院病理科副主任醫(yī)師笪倩,分享了時空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案與數(shù)字智慧病理結(jié)合的應(yīng)用案例。笪老師闡述了數(shù)字智慧病理的臨床現(xiàn)狀、時空淋巴瘤智能診斷平臺的設(shè)計,以及淋巴瘤時空轉(zhuǎn)錄組FFPE預(yù)實驗數(shù)據(jù)。笪老師深入探討時空組學(xué)技術(shù)與人工智能診斷結(jié)合,具有提高病理診斷的效率和準(zhǔn)確性的臨床應(yīng)用潛能。她表示,時空組學(xué)技術(shù)不僅提高了數(shù)據(jù)的科學(xué)性,也為回顧性臨床試驗提供了堅實的數(shù)據(jù)基礎(chǔ),推動了個性化診療的發(fā)展。
上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院病理科副主任醫(yī)師笪倩
中南大學(xué)湘雅醫(yī)院特聘副研究員張冠雄,分享了多模態(tài)數(shù)據(jù)整合和機(jī)器學(xué)習(xí)在皮膚疾病,尤其是銀屑病治療中的應(yīng)用。他指出了當(dāng)前皮膚病治療面對的挑戰(zhàn),尋找新的靶點是治療皮膚病的關(guān)鍵。時空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案能夠以近似單細(xì)胞分辨率刻畫皮膚組織細(xì)胞組分及空間分布,進(jìn)而可以識別皮膚病中潛在的新治療靶點。
中南大學(xué)湘雅醫(yī)院特聘副研究員張冠雄
中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院消化內(nèi)科李曉智博士,在現(xiàn)場分享了時空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案在宿主-微生物互作方面的研究。基于時空轉(zhuǎn)錄組FFPE,李曉智博士在研究中精確描繪腸道各層的顯微結(jié)構(gòu)和細(xì)胞分布,同時原位檢測了微生物的空間分布和表達(dá)豐度。研究發(fā)現(xiàn)微生物與周圍細(xì)胞的互作可以在一定程度上解釋炎癥性腸病的空間異質(zhì)性,為闡明炎癥性腸病等消化系統(tǒng)疾病的分子機(jī)制提供客觀證據(jù)。
中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院消化內(nèi)科李曉智博士
賦能青年科學(xué)家研究創(chuàng)新
為助力青年科學(xué)家的科研發(fā)現(xiàn),華大時空組學(xué)于2022年、2023年連續(xù)發(fā)起了兩期“青年科學(xué)家激勵計劃”,累計為35個入選項目提供了科研支持。2024年激勵計劃再出發(fā),時空組學(xué)專項科學(xué)家張佳君在本次發(fā)布會上,發(fā)布了“見‘微’知著——華大時空組學(xué)中國區(qū)青年科學(xué)家激勵計劃(第三期)”。
時空組學(xué)專項科學(xué)家張佳君
該計劃旨在支持廣泛的科研領(lǐng)域,包括但不限于各類疾病研究(動物模型研究、病原微生物研究等),并鼓勵國內(nèi)青年科研人員利用時空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案進(jìn)行微生物檢測和宿主-微生物互作的科學(xué)研究。評審委員會最終將評選出5個科研項目,并為入選項目提供2-4個FFPE樣本的時空轉(zhuǎn)錄組支持(芯片規(guī)格為1cmx1cm)。生化實驗、測序和標(biāo)準(zhǔn)分析等服務(wù)和收費標(biāo)準(zhǔn)由華大時空組學(xué)生態(tài)合作伙伴提供。
時空組學(xué)照亮浩瀚生命,工具創(chuàng)新助力新質(zhì)未來。華大時空組學(xué)在開發(fā)前沿技術(shù)工具的同時,也積極致力于推進(jìn)全球科研合作和生態(tài)合作伙伴建設(shè),打造時空生態(tài)圈。目前,華大時空組學(xué)已與海內(nèi)外20多家生物科技公司達(dá)成合作,時空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案也將在各生態(tài)合作伙伴開放訂購。
未來,華大時空組學(xué)將繼續(xù)開發(fā)通用且功能強(qiáng)大的工具,攜手生態(tài)合作伙伴,共同助力廣大科研工作者進(jìn)行更廣、更深層次的組學(xué)探索,在生長發(fā)育、生命演化、器官結(jié)構(gòu)、疾病機(jī)制等研究領(lǐng)域取得創(chuàng)新突破,推動生命科學(xué)行業(yè)加速發(fā)展。
注:時空組學(xué)多款產(chǎn)品方案已在華大智造官網(wǎng)上線,時空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案同步上新,點擊“閱讀原文”即刻了解。